现在,你无需经过羊驼免疫,通过天然文库筛选即可获得想要的纳米抗体序列。纳博生命构建的羊驼VHH天然文库,里面包含了来自不同羊驼个体的VHH基因的多样性序列,只需客户提供抗原,就可以直接进行筛选。天然文库的优势在于:周期短、库容大、品质高。库容达1.3*1011cfu/mL,库品质高,2-3周即可获得特异性好的纳米抗体序列。适用于对羊驼有毒性的抗原以及低免疫原性的抗原。
羊驼VHH天然文库构建和流程测试
羊驼VHH天然文库构建,第一步是PBMC的分离,以下是步骤和流程。
(1)往已加入抗凝血剂的静脉外周血中加入等体积的D-PBS稀释,混合均匀。
(2)将淋巴细胞分离液注入密度梯度离心管,每管注入15mL。
(3)保持密度梯度离心管垂直,通过血清移液管将稀释的静脉外周血沿着管壁加入。PBMC样品会和隔板上方的分离液混合,但不影响分离效果。
(4)使用水平转子离心机,在开启离心机制动器的情况下,室温1200g离心10分钟。
(5)离心完成后,将密度梯度离心管中最上层不含细胞的血浆和D-PBS稀释液吸出,保留5 mL血浆用作效价检测。
(6)缓慢吸出包含淋巴细胞的上层稀释液至新的无菌离心管中,添加1倍体积的D-PBS,室温1000g离心10分钟洗涤细胞。
(7)离心完成后,弃去上清,将底部沉淀得到的PBMC置于-80℃超低温冰箱冻存。
噬菌体表面展示文库构建流程介绍
噬菌体表面展示文库构建流程包括:总RNA提取、反转录、PCR扩增、酶切与连接、电转化TG1感受态细胞、到最后的收集文库。
图为噬菌体表面展示文库构建流程示意
噬菌体表面展示文库构建——实验过程简述
(1)总RNA提取:合并全部提取得到的PBMC,使用柱吸附法提取总mRNA;
(2)反转录:以提取得到的总mRNA为模板,反转录得到cDNA ;
(3)PCR:使用适当的DNA引物,以上述cDNA为模板,经聚合酶链式反应(PCR)扩增得到羊驼免疫球蛋白IgG2和IgG3的VHH片段,即纳米抗体的DNA片段 ;
(4)酶切与连接:①载体酶切:双酶切制备线性化的噬菌体表面展示筛选载体DNA质粒; ②片段酶切:双酶切VHH的DNA片段; ③连接载体与片段:使用T4 DNA连接酶连接酶切后的载体与片段,得到完整的VHH噬菌体表面展示筛选质粒文库,即VHH-pIII融合蛋白表达载体质粒文库。其中,pIII是存在于噬菌体表面鞭毛上的蛋白质;
(5)电转化TG1感受态细胞:将DNA连接产物经电转化方法,转化至TG1大肠杆菌感受态细胞,共电转96份连接产物;
(6)收集文库:适当培养收集后的全部菌落,即为免疫羊驼的纳米抗体文库。期间使用梯度稀释法计量电转后之后、培养前的文库大小,约1.56×109cfu.
(1)从文库中随机挑取不少于48个微生物单克隆,37℃培养过夜后,提取DNA质粒、进行Sanger测序。(2)将全部测序结果进行翻译后得到48条正确、有效的纳米抗体序列(见附件),其中包括48种完全不同的CDR3区域(如图示)。
图示:48条测序结果的CDR3区域氨基酸序列比对
片段插入率测试
(1)对上述48个微生物单克隆的VHH片段进行PCR扩增;(2)对PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,评估VHH片段插入率
图示:48条VHH基因片段扩增产物的琼脂糖凝胶电泳分析结果
从电泳分析结果来看,48个微生物单克隆中有45个可以较好地PCR扩增出VHH基因片段,另有3个单克隆无法经PCR扩增。考虑到上文VHH片段的Sanger测序全部正确,此处3个单克隆的VHH片段无法扩增属人为实验误差,不影响对问题多样性的评价。